张世华，博士，教授，硕士生导师，主要研究方向为机器学习/人工智能、生物信息学、AI与医工交叉，健康大数据挖掘。2006年毕业于华中科技大学，2011年茶树种质创新与资源利用全国重点实验室博士后，2016年美国佐治亚大学访问学者，主要讲授《程序设计语言》、《数据结构》、《生物信息学》等本科生/研究生课程。

主持科研项目

国家自然科学基金（62541212, 62172312, 31301248）

中国博士后基金面上项目（2013M531498）

中央高校专项资金重点项目（CZZ24010）

全国重点实验室开放课题(SKLTOF20160113）

学术任职

外国优秀青年学者研究基金评审专家

国家自然科学基金评审专家

吴文俊人工智能科学技术奖评审专家

中国计算机学会生物信息学专业委员会委员

中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会委员

中国生物信息学学会多组学与整合生物学专委会委员

湖北省生物信息学会理事

湖北省第十一届博士服务团入选者

BIIP/ICIC等会议的program member

代表性论文

1. Bo Li, Yongkang Zhao, Jing Hu, Shihua Zhang^*, scSAMAC: saliency-adjusted masking induced attention contrastive learning for single-cell clustering, 2025, 26(2), bbaf128

2. Bo Li, Chen Peng, Zeran You, Xiaolong Zhang, Shihua Zhang^*, Single-cell RNA-sequencing data clustering using variational graph attention auto-encoder with self-supervised learning, Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(6), 1-15

3. Shihua Zhang, Xiaolong He, Rui Zhang, and Wensheng Deng, LncR2metasta: a manual curated database for experimentally supported lncRNAs during various cancer metastatic events, Briefings in Bioinformatics, 2021, 22(3), 1-6

4. Bo Li, Yihui Tian, Yang Tian, Shihua Zhang*, and Xiaolong Zhang*, Predicting Cancer Lymph-node Metastasis from LncRNA Expression Profiles using Local Linear Reconstruction Guided Distance Metric Learning, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2022, DOI: 10.1109/TCBB.2022.3149791

5. Shihua Zhang, Hongdong Xuan, Liang Zhang, Sicong Fu, Yijun Wang, Hua Yang, Yuling Tai, Youhong Song, Jinsong Zhang, Chi-Tang Ho, Shaowen Li and Xiaochun Wan, TBC2health: a database of experimentally validated health-beneficial effects of tea bioactive compounds, Briefings in Bioinformatics 2017, 18(5), 830-36

6. Rui Zhang, Yong Ma, Xiaoyi Hu, Ying Chen, Xiaolong He, Ping Wang, Qi Chen, Chi-Tang Ho, Xiaochun Wan, Youhua Zhang and Shihua Zhang*, TeaCoN: a database of gene co-expression network for tea plant (Camellia sinensis), BMC Genomics 2020, 21:461  

7. De’en Yu, Cheng Zhang, Yeman Zhou, Heng Yang, Chen Peng, Feng Zhang, Xinghua Liao, Yuan Zhu, Wensheng Deng, Bo Li, and Shihua Zhang*, ncR2Met (lncR2metasta v2.0): An updated database for experimentally supported ncRNAs during cancer metastatic events, Genomics 2023, 115(2): 110569

8. Tong Zhang, Yixuan Lin, Weimin He, FengXin Yuan, Yu Zeng, and Shihua Zhang*, GCN-GENE: A novel method for prediction of coronary heart disease-related genes, Computers in Biology and Medicine, 2022, 105918

发明专利

一种基于茶叶生化成分的绿茶苦涩味判别方法，发明人：张世华等，专利号：CN201310571437.6，中国发明专利

教材撰写

《生物信息学》、科学出版社、“十四五”普通高等教育本科规划教材、编委

欢迎加入本课题组

本课题组招收有志于人工智能、深度学习算法，AI与医工交叉研究方向的研究生。

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