联盟设立理事会和秘书处，理事会是专业指导机构，秘书处是日常运行机构。
理事会由成员单位分别推荐代表组成, 主要职责如下：
（一）制定和修改联盟章程；
（二）选举和罢免领导机构成员；
（三）制定联盟年度工作方案；
（四）审议常务理事会年度工作报告；
（五）审议通过联盟常务理事会或理事提出的议案；
（六）制定联盟基本规章制度。
理事长、副理事长是常务理事，组成常务理事会，职责是：
（一）执行理事会决议；
（二）实施联盟年度工作方案；
（三）根据联盟发展实际，提交联盟发展有关议案；
（四）决定理事会召开的时间、地点和审议的主要内容；
（五）在理事会闭会期间,讨论和决定联盟的有关重要事项；
秘书处是联盟理事会及其常务理事会的常设办事机构,办公地点设在中南民族大学教师教学发展中心，其主要职责如下：
（一）负责联盟年度工作方案的落实；
（二）收集、发布联盟活动信息；
（三）负责联盟的宣传和档案管理等工作；
（四）筹备组织理事大会和常务理事会议，负责起草会议文件，撰写工作报告；
（五）创办联盟网站并维护其正常运行, 负责联盟的联络工作；
（六）负责联盟的财务管理工作。
